เรื่องราวของไซเบอร์ฟอร์มูล่าเริ่มต้นที่ “คาซามิ ฮายาโตะ” เด็กหนุ่มวัย 14 ปี ผู้ตั้งมั่นจะเป็นนักแข่งรถมอเตอร์ไซด์มืออาชีพ ได้มาพบกับรถซิ่งที่มีระบบสมองกลที่ชื่อว่า “อาสึราดะG.S.X.” (หรือ อัสราด้า =Asrada) ที่เป็นเป้าหมายของผู้ก่อการร้ายที่ต้องการเอาไปใช้ในสงครามในขณะนั้น เขาจำป็นต้องขับรถซิ่งที่มีสมองกลรายนี้ส่งคืนให้กับทีมรถแข่งCyber Formula ที่ชื่อ “ซูโก อาสึราดะ” ที่กำลังรอรถแข่งไซเบอร์ฟอมูล่าคันใหม่ให้ทันเวลารอบคัดเลือกการแข่งระดับโลก แต่ทว่าระบบ AI ของ อาสึราดะG.S.X. “สามารถลงทะเบียนคนขับได้เพียงครั้งเดียว” ฮายาโตะจึงกลายเป็นนักแข่งรถไซเบอร์ฟอมูล่าแบบไม่ได้ตั้งใจนักนับแต่นั้นมา