“ฮันเดรด” อาวุธเพียงหนึ่งเดียวที่สามารถต่อต้านสิ่งมีชีวิตปริศนา “ซาเวจ” ที่เข้ามารุกรานโลก โดย “สเลเยอร์” คือชื่อของผู้ใช้อาวุธฮันเดรด “คิซารากิ ฮายาโตะ” ผู้ที่สมัครเข้าเป็นนักเรียนในโรงเรียนที่อยู่ในเมืองกลางทะเลที่ชื่อว่า “ลิตเติ้ลการ์เด้น” และได้พบกับ “เอมิล ครอสฟอร์ด” เพื่อนร่วมห้องที่เหมือนจะรู้จักเขามาก่อนและเขาก็เหมือนรู้จักเอมิลมาก่อนเช่นกัน และเมื่อเขาเข้ามาโรงเรียนไม่ทันไรก็ถูกท้าดวลโดย “ควีน” สเลเยอร์ผู้แข็งแกร่ง และนี่คือจุดเริ่มต้นของเรื่องราวทั้งหมด